Vědci vytvořili struktury podobné cytoskeletu z RNA

RNA origami uvnitř umělých buněk: Nový krok k syntetickému životu

Vědcům z Heidelberské univerzity se podařilo něco, co ještě nedávno působilo jako science fiction – vytvořili samoorganizující se nanotrubice a kruhy z RNA přímo uvnitř umělých buněk, tzv. lipidových váčků. Tento pokrok by mohl urychlit vývoj syntetických buněk, které najdou využití ve výzkumu, diagnostice i terapii.


🧬 RNA jako stavební materiál

DNA a RNA jsou především známé jako nosiče genetické informace, ale zároveň mají unikátní vlastnosti, díky kterým mohou sloužit i jako „stavební bloky“. V přírodě to známe například u ribozomů – komplexních struktur částečně tvořených RNA.

Vědci už dříve vyvinuli techniku známou jako DNA a RNA origami, kdy lze pečlivě navržené sekvence těchto molekul přimět, aby se samy složily do specifických tvarů. Výsledkem jsou například DNA „krabičky“ pro cílené doručení léků nebo složité 3D struktury.

Nová studie však posunula RNA origami o velký krok dál – přímo uvnitř syntetických buněk, a to bez nutnosti vnějšího zásahu.


🧪 Nanotrubice, prstence i sítě

Tým pod vedením dr. Kerstin Göpfrich navrhl speciální RNA dlaždice, které se po transkripci automaticky složí a propojí do mikrometrových RNA nanotrubic – podobných vnitřní kostře buněk, tzv. cytoskeletu.

Celý proces probíhal uvnitř tzv. GUVs – obřích unilamelárních lipidových váčků, které fungují jako jednoduché napodobeniny buněčných membrán. Do těchto váčků vědci vložili:

  • DNA šablony pro RNA origami
  • RNA polymerázu, enzym pro transkripci DNA do RNA
  • Ionofor α-hemolysin, který umožnil vstup nukleotidů a výstup vedlejších produktů

Přidání hořečnatých iontů (Mg²⁺) spustilo transkripci a RNA se ihned začala sama organizovat do prostorových struktur.


🔁 Změny v šabloně, změny ve tvaru

Již malé úpravy DNA šablony vedly k zásadním změnám tvaru výsledné RNA struktury – z nanotrubic se mohly stát prstence. To ukazuje na vysokou flexibilitu této metody.

Díky přidání tzv. aptamerů – RNA sekvencí schopných vázat se na jiné molekuly – vznikly sítě RNA trubic, které dosahovaly velikosti desítek mikrometrů. V některých případech se tyto sítě připojily k membráně váčku a vytvořily strukturu připomínající kortex, tedy specializovanou buněčnou výstelku známou ze skutečných buněk.


🧱 RNA origami jako stavební systém

Jednou z výhod RNA origami je, že vše může vznikat přímo uvnitř buňky z jednoduché DNA šablony pomocí pouze jednoho enzymu – T7 polymerázy. To kontrastuje s klasickým buněčným „továrním“ systémem, který vyžaduje více než 150 genů.

To otevírá cestu k minimálním syntetickým buňkám, které si samy vyrábějí své „stavební díly“ – a přitom nevyžadují celý biologický překladový aparát.


⚙️ Možnosti a budoucnost

Možné využití RNA origami sahá od výzkumu přes medicínu až po stárnutí:

  • Vývoj syntetických buněk, které zvládnou jednoduché úkoly – například produkci kolagenu nebo elastinu pro opravu tkání.
  • Biomimetické systémy, které napodobují funkce skutečných buněk.
  • Cílená léčba: Vkládání RNA struktur do existujících buněk k posílení jejich stability nebo funkce.
  • Studium vývoje života: RNA je jedním z kandidátů na první molekuly života – tato technologie může pomoci pochopit jeho původ.

V budoucnu by RNA origami struktury mohly být víc než jen statické nosiče. Přidáním tzv. ribozymů (RNA s enzymatickou aktivitou) by mohly aktivně řídit buněčné procesy. Cílem je vytvořit funkční molekulární stroje uvnitř umělých buněk.


📸 Vizualizace

RNA cytoskeleton 1
Nanotrubice tvořené RNA uvnitř syntetických buněk.

RNA cytoskeleton 2
Rozsáhlé sítě RNA struktur připomínající cytoskelet reálných buněk.


📚 Zdroje a literatura:

  • [1] Tran, M. P., et al. (2025). Genetic encoding and expression of RNA origami cytoskeletons in synthetic cells. Nature Nanotechnology, https://doi.org/10.1038/s41565-025-01879-3
  • [2] Dey, S., et al. (2021). DNA origami. Nature Reviews Methods Primers, 1(1), 13.
  • [3] Udomprasert, A., & Kangsamaksin, T. (2017). DNA origami applications in cancer therapy. Cancer Science, 108(8), 1535–1543.

Tato fascinující technologie představuje další krok na cestě k životu vytvořenému člověkem. Syntetické buňky založené na RNA by jednoho dne mohly pomáhat léčit, regenerovat a dokonce nahrazovat poškozené části těla – s přesností, jakou si dnes můžeme jen představit.